ANTOSİYANİN DNA BAĞLANMA ÖZELLİKLERİNİN MOLEKÜLER DOCKİNG YÖNTEMİ İLE BELİRLENMESİ

Abstract

Dünyada en fazla ölüme sebep olan hastalık arasında kanser yer almaktadır. Kanser tedavisinde en yaygın Pt (II) temelli ilaçlar kullanılmaktadır. Ancak kullanılan Pt (II) temelli yan etkileri ve yüksek konsantrasyonları sebebiyle yeni alternatif oalbilecek bileşiklere ihtiyaç vardır. Antosiyaninin antikanser etkinliğine dair çalışmalar vardır ancak antosiyaninlerin antikanser ajanları olarak kullanımına ilişkin temel endişe, bunların zayıf biyoyararlanımı, daha spesifik olarak zayıf emilimi ve biyodağılımıdır. Bu bölümde antosiyanin DNA ile bağlanma etkileşimleri incelenerek bu konuya moleküler düzeyde açıklık getirmek amaçlanmıştır. DNA (PDB ID: 1BNA) yapısı protein veri bankasından alındı. Ligand yapısında kullandığımız antosiyaninde PubChem veri tabanından alındı. Sonuç olarak antosiyaninin 1BNA DNA yapısına iyi bir affinite ile bağlandığını gösterdi. Özetle, bu çalışma ile antosiyaninlerin moleküler düzeyde 1BNA DNA yapısına bağlanma etkileşiminin iyi olduğunu ve Pt temelli ilaçlar ile daha fazla kıyaslamalar yapılarak in vivo ve in vitro çalışmalara destek sağlayacağını ön görmekteyiz.